ソフトウェアのインストールなどにより、tortoriseSVNのオーバーレイアイコンが表示されなくなることがあります。原因としては、ShellIconOverlayIdentifiersキーの値の個数が多すぎることが挙げられます。

ShellIconOverleyIdentifilersキーのフルパスは
です。
下図は、TortoriseSVNのオーバーレイアイコンが表示されなくなったWindowsのShellIconOverlayIdentifilersキーの値です。

Microsoft Ofiice Grooveをインストールしたため、OverlayIconの登録キー数が多くなりすぎたようです。

• Groove Explorer Icon Overlay 1
• Groove Explorer Icon Overlay 2
• Groove Explorer Icon Overlay 2.5
• Groove Explorer Icon Overlay 3
• Groove Explorer Icon Overlay 4

のキーを削除し、再起動することで、TortoriseSVNのオーバーレイアイコンが再び表示されるようになりました。